Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK13-1Q9NX77 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms