Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAK1IP1Q9NWT1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms