Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCLQ9NW38 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms