Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCL28Q9NRJ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms