Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTA1Q9NP79 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTA1Q9NP79 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms