Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELL3Q9HB65 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms