Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms