Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP4Q9BWG4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms