Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM2Q9BVW6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM2Q9BVW6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms