Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms