Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms