Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX2Q99697 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms