Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNS1Q96KK3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KCNS1Q96KK3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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KCNS1Q96KK3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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KCNS1Q96KK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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KCNS1Q96KK3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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