Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms