Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSPRY1Q96DX4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPRY1Q96DX4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPRY1Q96DX4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPRY1Q96DX4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPRY1Q96DX4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPRY1Q96DX4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPRY1Q96DX4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPRY1Q96DX4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSPRY1Q96DX4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms