Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRIPQ8WXE1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms