Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms