Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC12Q8WUD4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms