Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GIPC3Q8TF64 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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