Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATG16L2Q8NAA4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms