Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00469Q8N7U9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms