Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APTXQ7Z2E3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APTXQ7Z2E3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms