Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms