Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LRIG3Q6UXM1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRIG3Q6UXM1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms