Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO3Q6UWJ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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