Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC137Q6PK04 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms