Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3HQ6NTF7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms