Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms