Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIF1Q5UIP0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIF1Q5UIP0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms