Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC18Q5T9S5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC18Q5T9S5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC18Q5T9S5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC18Q5T9S5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC18Q5T9S5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC18Q5T9S5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC18Q5T9S5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC18Q5T9S5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC18Q5T9S5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC18Q5T9S5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC18Q5T9S5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC18Q5T9S5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC18Q5T9S5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms