Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms