Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP28Q4G0W2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms