Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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NRF1Q16656 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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NRF1Q16656 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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NRF1Q16656 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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NRF1Q16656 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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NRF1Q16656 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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NRF1Q16656 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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