Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms