Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD1Q15011 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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