Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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