Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN1Q14457 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN1Q14457 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms