Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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