Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDX39BQ13838 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms