Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSTA3Q13630 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSTA3Q13630 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSTA3Q13630 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSTA3Q13630 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TSTA3Q13630 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TSTA3Q13630 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSTA3Q13630 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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