Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC1Q13547 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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