Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TUBB3Q13509 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TUBB3Q13509 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TUBB3Q13509 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TUBB3Q13509 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TUBB3Q13509 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TUBB3Q13509 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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TUBB3Q13509 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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