Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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UBE2V1Q13404 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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