Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRDM2Q13029 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
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