Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX10Q12887 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX10Q12887 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX10Q12887 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX10Q12887 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX10Q12887 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COX10Q12887 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COX10Q12887 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COX10Q12887 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COX10Q12887 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COX10Q12887 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
COX10Q12887 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COX10Q12887 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COX10Q12887 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
COX10Q12887 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COX10Q12887 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
COX10Q12887 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COX10Q12887 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COX10Q12887 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COX10Q12887 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms