Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 ATG2YNL242W 4779 nt3.98□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 PTA1YAL043C 2358 nt3.98□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 TFB1YDR311W 1929 nt3.98□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 PMP1YCR024C-A 123 nt3.98□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.98□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 YLR255CYLR255C 354 nt3.98□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 GYP7YDL234C 2241 nt3.98□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 FRE8YLR047C 2061 nt3.98□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 HFM1YGL251C 3564 nt3.97□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 STE23YLR389C 3084 nt3.97□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 FAS2YPL231W 5664 nt3.97□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 PHM6YDR281C 315 nt3.97□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 USE1YGL098W 738 nt3.97□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 RPS12YOR369C 432 nt3.97□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 CWC22YGR278W 1734 nt3.97□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 CDC27YBL084C 2277 nt3.97□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 ACE2YLR131C 2313 nt3.96□□□□□ -1.77
SRF1Q12516 VPS54YDR027C 2670 nt3.96□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YEL073CYEL073C 324 nt3.96□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.96□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YPR053CYPR053C 456 nt3.96□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 TCP1YDR212W 1680 nt3.96□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 NCL1YBL024W 2055 nt3.96□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 MPS1YDL028C 2295 nt3.96□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 SRP72YPL210C 1923 nt3.95□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YPK1YKL126W 2043 nt3.95□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 snR79snR79 84 nt3.95□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 SSS1YDR086C 243 nt3.95□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 RPL6AYML073C 531 nt3.95□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YPR146CYPR146C 330 nt3.95□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 TRZ1YKR079C 2517 nt3.95□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 MUK1YPL070W 1839 nt3.95□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 GUP1YGL084C 1683 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 PDC2YDR081C 2778 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 ARK1YNL020C 1917 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YJL181WYJL181W 1836 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YDR286CYDR286C 345 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 PMC1YGL006W 3522 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 CWH41YGL027C 2502 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 JJJ2YJL162C 1752 nt3.94□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 RPG1YBR079C 2895 nt3.92□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 MIS1YBR084W 2928 nt3.92□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 COX23YHR116W 456 nt3.92□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 POL3YDL102W 3294 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YDL176WYDL176W 2127 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 CIN1YOR349W 3045 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 ERP6YGL002W 651 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 BRP1YGL007W 378 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 YIL058WYIL058W 285 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 VAC7YNL054W 3498 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 IOC2YLR095C 2439 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 PEP5YMR231W 3090 nt3.91□□□□□ -1.78
SRF1Q12516 SSQ1YLR369W 1974 nt3.91□□□□□ -1.78
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SRF1Q12516 ETP1YHL010C 1758 nt3.9□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 ULI1YFR026C 510 nt3.9□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 EMP24YGL200C 612 nt3.9□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YJL022WYJL022W 309 nt3.9□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 TRX1YLR043C 312 nt3.9□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 GIS2YNL255C 462 nt3.9□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 FAA2YER015W 2235 nt3.9□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 KIC1YHR102W 3243 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 AIM11YER093C-A 414 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YIL059CYIL059C 366 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YML007C-AYML007C-A 111 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 RPS7AYOR096W 573 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 RPL33BYOR234C 324 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 BUB1YGR188C 3066 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 OLE1YGL055W 1533 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 IOC3YFR013W 2364 nt3.89□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 SEC15YGL233W 2733 nt3.88□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 PIG1YLR273C 1947 nt3.88□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 CDH1YGL003C 1701 nt3.88□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.88□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 RAD5YLR032W 3510 nt3.87□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 REG1YDR028C 3045 nt3.87□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.87□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 RSC1YGR056W 2787 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 RAD1YPL022W 3303 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 GCD6YDR211W 2139 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YOL057WYOL057W 2136 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YDR341CYDR341C 1824 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YNL034WYNL034W 1839 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 NOP53YPL146C 1368 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 BRO1YPL084W 2535 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 SEN1YLR430W 6696 nt3.85□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 MUS81YDR386W 1899 nt3.84□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 GRS2YPR081C 1857 nt3.84□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 QCR7YDR529C 384 nt3.84□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 GYL1YMR192W 2163 nt3.84□□□□□ -1.79
SRF1Q12516 YGL140CYGL140C 3660 nt3.84□□□□□ -1.8
SRF1Q12516 PWP2YCR057C 2772 nt3.84□□□□□ -1.8
SRF1Q12516 BAS1YKR099W 2436 nt3.83□□□□□ -1.8
SRF1Q12516 YEL043WYEL043W 2871 nt3.83□□□□□ -1.8
SRF1Q12516 SPT23YKL020C 3249 nt3.83□□□□□ -1.8
SRF1Q12516 ECM12YHR021W-A 456 nt3.83□□□□□ -1.8
SRF1Q12516 HSC82YMR186W 2118 nt3.83□□□□□ -1.8
SRF1Q12516 CAF120YNL278W 3183 nt3.82□□□□□ -1.8
SRF1Q12516 VBA4YDR119W 2307 nt3.82□□□□□ -1.8
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