Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 EPT1YHR123W 1176 nt0.59□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 snR191snR191 274 nt0.59□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YSW1YBR148W 1830 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YJL022WYJL022W 309 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 CSE1YGL238W 2883 nt0.58□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 COX1Q0045 1605 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 NSE4YDL105W 1209 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YBR063CYBR063C 1215 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YFR056CYFR056C 369 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YGR114CYGR114C 390 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 RPS10AYOR293W 318 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 SNC2YOR327C 348 nt0.57□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YGL138CYGL138C 1038 nt0.56□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 MYO1YHR023W 5787 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YCR015CYCR015C 954 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 FYV4YHR059W 393 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YNL010WYNL010W 726 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 DSE1YER124C 1722 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 WAR1YML076C 2835 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 NSE3YDR288W 912 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YGL118CYGL118C 438 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 RPL6BYLR448W 531 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 FIG1YBR040W 897 nt0.55□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 RPL40AYIL148W 387 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 RIF2YLR453C 1188 nt0.54□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 UPF3YGR072W 1164 nt0.53□□□□□ -2.32
TY1B-BRQ12193 YGL177WYGL177W 348 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 SVP26YHR181W 687 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YIM2YMR151W 438 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 AZF1YOR113W 2745 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 SRB4YER022W 2064 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YBL094CYBL094C 333 nt0.52□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 HIR3YJR140C 4947 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 DGR2YKL121W 2559 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 CDC5YMR001C 2118 nt0.51□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 NCA2YPR155C 1851 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 snR68snR68 136 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YDR042CYDR042C 603 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 ALK1YGL021W 2283 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 MVP1YMR004W 1536 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 PCL2YDL127W 927 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 SMD1YGR074W 441 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YGR250CYGR250C 2346 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YLR402WYLR402W 192 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 CYB5YNL111C 363 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YNL179CYNL179C 438 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YGL039WYGL039W 1047 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 REX3YLR107W 1215 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 LSM7YNL147W 348 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 MER1YNL210W 813 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 RGI1YER067W 486 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 RAM2YKL019W 951 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 CMC2YBL059C-A 330 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YIL089WYIL089W 618 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 UFE1YOR075W 1041 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 UAF30YOR295W 687 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 snR35snR35 204 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 ADF1YCL058W-A 342 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-BRQ12193 YML002WYML002W 2214 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YDR286CYDR286C 345 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 PRS3YHL011C 963 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YMR147WYMR147W 672 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 ARL3YPL051W 597 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YLL007CYLL007C 1998 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YIL012WYIL012W 342 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 SPP381YBR152W 876 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YFR054CYFR054C 579 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 RPL38YLR325C 237 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 MRPL40YPL173W 894 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 MGR1YCL044C 1254 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YHL012WYHL012W 1482 nt0.44□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YLL054CYLL054C 2532 nt0.43□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 SNA4YDL123W 423 nt0.43□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YIP1YGR172C 747 nt0.43□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YNL089CYNL089C 477 nt0.43□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 NUP120YKL057C 3114 nt0.43□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 CIN2YPL241C 807 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 BFR1YOR198C 1413 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 HYR1YIR037W 492 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YMR178WYMR178W 825 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 snR45snR45 172 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 PSO2YMR137C 1986 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 ABM1YJR108W 372 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 PEX15YOL044W 1152 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 RPB5YBR154C 648 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 MDM36YPR083W 1740 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 LYS14YDR034C 2373 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-BRQ12193 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 RPL9AYGL147C 576 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 TCA17YEL048C 459 nt0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.8 ms