Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CKAP4Q07065 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms