Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms