Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms